13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0817 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0711    100 
 
 		 3753 bp  2710    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0817    100 
 
 		 4523 bp  8966    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2665    98.42 
 
 		 7798 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2667    98.42 
 
 		 5883 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 363 bp  159  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  90.7 
 
 		 2508 bp  54  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  96.77 
 
 		 3552 bp  54  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  91.89 
 
 		 5568 bp  50.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4107  hypothetical protein  93.94 
 
 		 765 bp  50.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.408855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2343  excinuclease ABC, A subunit  91.89 
 
 		 3015 bp  50.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.684635  decreased coverage  0.00406706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  91.89 
 
 		 2373 bp  50.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  86.79 
 
 		 1929 bp  50.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  85.96 
 
 		 4074 bp  50.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>