27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0779 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0779  Protein of unknown function DUF2505  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.242967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02610  Protein of unknown function (DUF2505)  31.68 
 
 
164 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.344177  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3647  Protein of unknown function DUF2505  31.21 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2822  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2866  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2849  hypothetical protein  29.94 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0780  Protein of unknown function DUF2505  28.82 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576817  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0652  hypothetical protein  29.76 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196949  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0665  hypothetical protein  29.76 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0160914  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0645  hypothetical protein  29.17 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6762  hypothetical protein  25.93 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0822  hypothetical protein  26.79 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0644  hypothetical protein  27.33 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0091  hypothetical protein  25.58 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0651  hypothetical protein  27.33 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0664  hypothetical protein  27.33 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0157573  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4964  hypothetical protein  25.95 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3116  hypothetical protein  28.97 
 
 
171 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.02824  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1222  hypothetical protein  32.03 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3383  hypothetical protein  26.97 
 
 
168 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3648  Protein of unknown function DUF2505  24.57 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10489  hypothetical protein  26.01 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.224481  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3798  hypothetical protein  22.7 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1883  hypothetical protein  23.75 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.960325 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2610  hypothetical protein  23.78 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.122572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08750  Protein of unknown function (DUF2505)  23.68 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131074  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1223  hypothetical protein  26.96 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>