17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3593 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3593  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  528  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3644  hypothetical protein  75.6 
 
 		 250 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6091  hypothetical protein  28.34 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0360  hypothetical protein  43.26 
 
 		 248 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0934561  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3073  hypothetical protein  28.83 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0765058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0651  hypothetical protein  26.58 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.577718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0928  hypothetical protein  27.21 
 
 		 236 aa  62  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00224597  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4176  hypothetical protein  23.46 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229359  normal  0.0939497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5404  hypothetical protein  30.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5457  hypothetical protein  30.37 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4800  hypothetical protein  33.68 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4812  hypothetical protein  31.01 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.831292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5342  hypothetical protein  33.68 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0194  hypothetical protein  32.56 
 
 		 192 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612383  normal  0.642506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1511  hypothetical protein  28.3 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3323  hypothetical protein  31.52 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0211  hypothetical protein  28.26 
 
 		 193 aa  48.9  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.449964 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>