25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3030 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3030  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.452629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1221  phosphoesterase PA-phosphatase related  93.12 
 
 		 218 aa  421  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0968  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.01 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.133557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3118  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.87 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3671  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.53 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3447  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.59 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0981  hypothetical protein  26.11 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0637  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.46 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2901  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.21 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0866647  normal  0.913295 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.87 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0607  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.97 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00776566  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0951  hypothetical protein  24.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.07 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1791  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.71 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.824897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0122  PAP2 family protein  31.19 
 
 		 325 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0131  PAP2 family protein  31.19 
 
 		 325 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.200996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0399  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.02 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149101  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1387  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.32 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.07 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2932  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.0854276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3158  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.71 
 
 		 203 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.873511  normal  0.780516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4017  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.89 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0691  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.46674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2558  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.13 
 
 		 255 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0088777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0381  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.73 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>