18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2494 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2494  PRC-barrel domain protein  100 
 
 
157 aa  319  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0957  PRC-barrel domain protein  57.96 
 
 
157 aa  186  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1677  PRC-barrel domain-containing protein  33.33 
 
 
563 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.998848  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3197  PRC-barrel domain-containing protein  29.3 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0772217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0207  hypothetical protein  26.28 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3578  hypothetical protein  32.37 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0227988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1194  PRC-barrel domain protein  24.65 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05720  PRC-barrel domain protein  30.07 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.443895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0107  PRC-barrel domain-containing protein  24.53 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0427071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0077  hypothetical protein  28.68 
 
 
220 aa  57.8  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1649  hypothetical protein  27.86 
 
 
152 aa  57.4  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0145454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0118  PRC-barrel domain protein  26.47 
 
 
301 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3233  hypothetical protein  25.62 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.306155 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0459  hypothetical protein  26.98 
 
 
268 aa  47.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3262  PRC-barrel domain-containing protein  32 
 
 
230 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1850  PRC-barrel domain-containing protein  28.36 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1752  PRC-barrel domain-containing protein  25.47 
 
 
157 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.153325  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2036  PRC-barrel domain-containing protein  25.47 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>