21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1361 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  100 
 
 		 473 aa  994    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  67.23 
 
 		 474 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  41.63 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  41.04 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  43.23 
 
 		 256 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1063 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  24 
 
 		 477 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  25.1 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  23.77 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  24.36 
 
 		 485 aa  110  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  26.88 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  23.68 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  21.93 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  23.38 
 
 		 507 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  23.39 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  24.68 
 
 		 525 aa  90.5  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  22.78 
 
 		 518 aa  90.1  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  22.91 
 
 		 517 aa  83.2  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  23.02 
 
 		 518 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  23.71 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1797  hypothetical protein  20.09 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329046  hitchhiker  0.00296843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>