20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0554 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0554  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  949    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3631  hypothetical protein  38.53 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0201  hypothetical protein  35.98 
 
 		 518 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.129066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6504  hypothetical protein  35.51 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1769  hypothetical protein  35.76 
 
 		 518 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.032794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1974  hypothetical protein  32.43 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.136534 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0104  hypothetical protein  27.51 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0194  hitchhiker  0.00000595624 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3344  hypothetical protein  24.61 
 
 		 474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2161  hypothetical protein  24.3 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5756  hypothetical protein  26.28 
 
 		 477 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3856  hypothetical protein  25.17 
 
 		 480 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.010908 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3762  hypothetical protein  25.85 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0434  hypothetical protein  26.79 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.536677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0336  Piwi domain protein  23.21 
 
 		 474 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.412943  normal  0.652066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1361  piwi domain-containing protein  23.39 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1065  hypothetical protein  21.26 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4040  hypothetical protein  22.81 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2569  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1063 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.682196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3109  hypothetical protein  21.96 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4746  piwi domain-containing protein  25.63 
 
 		 256 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>