35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1018 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  78.3 
 
 		 103 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  69.14 
 
 		 81 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  58.67 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0568  hypothetical protein  53.09 
 
 		 91 aa  94  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.145663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2376  hypothetical protein  41.25 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  37.84 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3956  hypothetical protein  37.68 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  38.24 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  35.53 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.97 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  39.39 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1650  hypothetical protein  38.55 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1569  hypothetical protein  38.89 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.997179  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  34.67 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2568  hypothetical protein  35.29 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1329  Protein of unknown function DUF2442  36.11 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.118395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  30.26 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0492  hypothetical protein  32.1 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  30.68 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  30.26 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  39.73 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1387  hypothetical protein  37.66 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1342  hypothetical protein  37.66 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0192  hypothetical protein  28.77 
 
 		 80 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.77367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  28.26 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  35.94 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  33.73 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4194  hypothetical protein  33.77 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2658  hypothetical protein  31.34 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0823788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  34.43 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1142  hypothetical protein  29.58 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0265  hypothetical protein  28.36 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  24.69 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1449  hypothetical protein  26.76 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>