39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6829 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  675    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  67.36 
 
 		 332 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  59.88 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  58.51 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  56.4 
 
 		 331 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  56.73 
 
 		 331 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  56.81 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  56.93 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  53.94 
 
 		 342 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  55.36 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  29.38 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  28.37 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  29.86 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  27.84 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  27.48 
 
 		 348 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  28.61 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  28.73 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  27.56 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  27.3 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  29.77 
 
 		 347 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  28.31 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  27.81 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  29.02 
 
 		 349 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  28.53 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  28.25 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  27.92 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  27.75 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  26.63 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  26.59 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  27.54 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  26.77 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  26.77 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  24.3 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  30.52 
 
 		 150 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  25.5 
 
 		 166 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  29.22 
 
 		 150 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0956  dehydratase  30.46 
 
 		 150 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  25.5 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  32.54 
 
 		 176 aa  43.5  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>