61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5852 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  77.68 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  50.15 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  50.31 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  49.55 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  51.04 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  49.85 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  51.04 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  48.8 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  48.8 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  48.8 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  48.8 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3752  protein of unknown function DUF95 transmembrane  53.1 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  47.62 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  48.96 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  45.71 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  45.43 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  44.18 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  45.4 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  44.58 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  46.87 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  42.94 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  41.43 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  43.29 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  31.37 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  29.07 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  31.65 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.48 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.3 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.13 
 
 		 331 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  28.37 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  31.35 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.47 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.22 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  31.17 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  26.83 
 
 		 326 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  29.45 
 
 		 325 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  28.83 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  28.34 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  28.62 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  25.69 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  28.31 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  30.59 
 
 		 356 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.07 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  22.94 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.54 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.26 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.52 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.27 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  22.5 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  21.36 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.34 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1030  hypothetical protein  34.59 
 
 		 215 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0346  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 		 528 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.160239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1639  hypothetical protein  31.68 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1427  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.79 
 
 		 511 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0144  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.08 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  26.85 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0289  integral membrane protein  34.18 
 
 		 246 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1138  hypothetical protein  30.71 
 
 		 189 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>