22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2399 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  37.17 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  41.34 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  40.89 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  33.46 
 
 		 240 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  37.82 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  27.45 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  41.44 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  41.04 
 
 		 169 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  28.71 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  34.87 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  33.68 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  36.13 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  35.29 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  31.72 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 		 456 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  21.25 
 
 		 390 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>