28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1526 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1526  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134054 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0068  hypothetical protein  27.11 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  23.92 
 
 
601 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2488  hypothetical protein  27.12 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3269  DNA polymerase beta domain protein region  28.93 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5084  nucleotidyltransferase domain-containing protein  32.58 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5092  nucleotidyltransferase domain protein  32.95 
 
 
292 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0047  nucleotidyltransferase domain-containing protein  26.99 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1803  DNA polymerase beta domain protein region  23.5 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4819  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5184  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.33 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0150  nucleotidyltransferase domain protein  32.18 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5090  nucleotidyltransferase domain protein  32.18 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4769  DNA polymerase beta subunit  29.89 
 
 
290 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2808  DNA polymerase beta domain protein region  28.31 
 
 
272 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3295  DNA polymerase beta domain protein region  27.76 
 
 
280 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4657  nucleotidyltransferase  31.82 
 
 
292 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5054  nucleotidyltransferase domain protein  31.82 
 
 
264 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2432  hypothetical protein  42.47 
 
 
269 aa  48.9  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4676  nucleotidyltransferase  30.68 
 
 
292 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3070  hypothetical protein  27.35 
 
 
280 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.830361  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0296  DNA polymerase beta domain protein region  28.94 
 
 
271 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0978  hypothetical protein  41.18 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2553  hypothetical protein  26.45 
 
 
272 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00280078  hitchhiker  0.00968431 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01305  conserved hypothetical protein  23.45 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0466824  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5656  3''-adenylyltransferase  26.05 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3552  nucleotidyltransferase  30.53 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0956  3''-adenylyltransferase  24.57 
 
 
260 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>