11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1358 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1358  SAF domain-containing protein  100 
 
 		 221 aa  420  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3333  hypothetical protein  43.07 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0265719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3417  SAF domain protein  33.15 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2220  SAF domain-containing protein  38.89 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4642  SAF domain-containing protein  34.55 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3136  SAF domain protein  35.53 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000294496  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0669  SAF domain protein  34.17 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2764  SAF domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0134302  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4972  SAF domain-containing protein  28.34 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0844  SAF domain protein  31.82 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.332054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4459  SAF domain-containing protein  29.1 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904172  normal  0.113707 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>