18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2814 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  100 
 
 		 558 aa  1073    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  37.14 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  36.07 
 
 		 428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  35.44 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  28.8 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  26.59 
 
 		 454 aa  90.1  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  29.12 
 
 		 439 aa  87.4  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  35.39 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  27.88 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  36.53 
 
 		 495 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  29.82 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  29.82 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  29.82 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  27.79 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  27.72 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  29.49 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  34.55 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>