20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2422 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2422  putative secreted protein  100 
 
 		 428 aa  819    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376537  normal  0.0559574 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4940  putative secreted protein  62.47 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2814  hypothetical protein  36.07 
 
 		 558 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.856062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4552  hypothetical protein  30.71 
 
 		 454 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  0.420738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37220  hypothetical protein  35.47 
 
 		 469 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2458  hypothetical protein  35.1 
 
 		 519 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00115564  normal  0.62035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3507  hypothetical protein  38.83 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4394  hypothetical protein  36.57 
 
 		 482 aa  96.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3753  hypothetical protein  30.87 
 
 		 445 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.18885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2465  hypothetical protein  35.53 
 
 		 495 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0489987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2158  secreted protein  33.45 
 
 		 477 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3061  hypothetical protein  33.69 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000314262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10417  hypothetical protein  31.37 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000130762  normal  0.910848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0200  hypothetical protein  30.19 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0532  hypothetical protein  30.07 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0554  hypothetical protein  29.11 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.656823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0542  hypothetical protein  29.11 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0705  hypothetical protein  30.83 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4401  hypothetical protein  30.55 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0879683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2229  hypothetical protein  25.91 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239901  hitchhiker  0.0000156459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>