14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0967 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0967  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  71.01 
 
 
322 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  62.71 
 
 
313 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  56.67 
 
 
319 aa  77.4  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  41.67 
 
 
313 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  45.71 
 
 
303 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  42.25 
 
 
331 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  43.14 
 
 
313 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  48.44 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  42.31 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  46.15 
 
 
313 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  37.5 
 
 
298 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  37.25 
 
 
313 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  40.38 
 
 
314 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>