34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0847 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  328  2e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  66.39 
 
 		 124 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  38.94 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  41.18 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  39.84 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  40.34 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  36.29 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  35.77 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  36.15 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  35.4 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  35.4 
 
 		 137 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  42.59 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  35.4 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  37 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  33.88 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  45.16 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  40.78 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  40.59 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  32.5 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  42 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  36.45 
 
 		 127 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  37.07 
 
 		 137 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  39.81 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  39.42 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  40.82 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1978  hypothetical protein  69.23 
 
 		 568 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  40.51 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  26.83 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.276759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  48.78 
 
 		 114 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  50 
 
 		 2397 aa  40.8  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>