29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3045 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  268  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  268  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  99.27 
 
 
137 aa  266  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  59.85 
 
 
136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  61.72 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  63.87 
 
 
137 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  47.1 
 
 
140 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  47.86 
 
 
150 aa  84  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  42.45 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  47.47 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  55.7 
 
 
162 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  42.34 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  38 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  38.26 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  31.2 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  48.61 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  34.68 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  33.96 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  34.95 
 
 
155 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  58.7 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  32.8 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  31.4 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  34.09 
 
 
200 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  35.34 
 
 
222 aa  48.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  60.53 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  37.68 
 
 
141 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  44.44 
 
 
153 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  28.33 
 
 
221 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  47.37 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>