33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1626 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1626  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0728  hypothetical protein  72.28 
 
 
365 aa  317  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2075  hypothetical protein  72.28 
 
 
365 aa  317  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1974  hypothetical protein  72.28 
 
 
366 aa  317  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0479  hypothetical protein  72.28 
 
 
368 aa  317  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1984  hypothetical protein  72.28 
 
 
365 aa  317  7e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000807908  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
405 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
382 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
394 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
433 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
410 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
426 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
386 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
394 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
412 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
389 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
384 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
387 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  37.04 
 
 
383 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0949  Integrase catalytic region  36.51 
 
 
346 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000104793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1887  hypothetical protein  60 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  31.13 
 
 
320 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  31.13 
 
 
320 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  31.13 
 
 
320 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 
339 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  29.8 
 
 
338 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  30.36 
 
 
325 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  30.36 
 
 
325 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  27.04 
 
 
349 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  31.13 
 
 
325 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>