33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1887 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1887  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2075  hypothetical protein  98.36 
 
 
365 aa  363  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1974  hypothetical protein  98.36 
 
 
366 aa  363  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0728  hypothetical protein  98.36 
 
 
365 aa  363  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1984  hypothetical protein  97.81 
 
 
365 aa  362  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000807908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0479  hypothetical protein  97.81 
 
 
368 aa  362  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  34.1 
 
 
412 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  34.68 
 
 
383 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  34.68 
 
 
387 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
394 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
382 aa  92.8  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
405 aa  92.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
386 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
433 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  33.71 
 
 
394 aa  92.4  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  34.27 
 
 
389 aa  92  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  34.1 
 
 
400 aa  92  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  34.1 
 
 
384 aa  92  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  34.1 
 
 
426 aa  91.7  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  34.1 
 
 
410 aa  91.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0949  Integrase catalytic region  33.15 
 
 
346 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000104793  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1626  hypothetical protein  60 
 
 
202 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1705  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0339  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0433  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.705419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1219  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1220  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1250  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1303  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1347  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.519975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3192  Integrase catalytic region  30.12 
 
 
378 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00354129  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  31.9 
 
 
327 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  31.9 
 
 
327 aa  43.5  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>