171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0479 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0479  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  764    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.475512  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0728  hypothetical protein  99.73 
 
 
365 aa  753    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1974  hypothetical protein  99.45 
 
 
366 aa  757    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1984  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  755    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000807908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2075  hypothetical protein  99.73 
 
 
365 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1887  hypothetical protein  97.81 
 
 
235 aa  362  6e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1626  hypothetical protein  72.28 
 
 
202 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0482  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
383 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.060676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1433  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
412 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.331457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1954  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
394 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
394 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1958  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
405 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1238  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
382 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00285925  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0459  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
387 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0147669  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1933  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0182276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1805  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0128  Integrase catalytic region  37.67 
 
 
389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000825928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0194  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
384 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0249438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1025  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
426 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0398  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
400 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1186  Integrase catalytic region  37.33 
 
 
410 aa  189  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0949  Integrase catalytic region  37 
 
 
346 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000104793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0529  Integrase catalytic region  28.14 
 
 
325 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.247566  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0538  Integrase catalytic region  28.14 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.189416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1950  Integrase catalytic region  28.14 
 
 
325 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  26.89 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  26.89 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  24.66 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  24.66 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  24.66 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  24.37 
 
 
349 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  23.24 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4857  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3309  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5758  integrase catalytic subunit  26.03 
 
 
338 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0647167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  21.25 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5102  integrase catalytic subunit  26.37 
 
 
339 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  24.84 
 
 
349 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1853  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
385 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3514  hypothetical protein  26.01 
 
 
310 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0359697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2732  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  20.89 
 
 
346 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
411 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
371 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  25.88 
 
 
362 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2869  Integrase catalytic region  26.18 
 
 
359 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.513593  normal  0.876471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
378 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
390 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1352  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1366  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000904408  decreased coverage  0.0000712993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0375  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
431 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
373 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
359 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
358 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
379 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
390 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1806  Integrase catalytic region  26.37 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.842149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0006  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000397696  normal  0.219937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  25.88 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>