34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2927 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2927  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2916  hypothetical protein  29.04 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2896  hypothetical protein  26.76 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2913  hypothetical protein  29.1 
 
 		 328 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.05 
 
 		 1585 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  25.64 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  30.09 
 
 		 287 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0002  ankyrin  28.17 
 
 		 578 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  22.33 
 
 		 483 aa  50.8  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  27.46 
 
 		 870 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  28.72 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  26.53 
 
 		 584 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0978  ankyrin repeat-containing protein  26.8 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.90033  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  30.77 
 
 		 203 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  27.12 
 
 		 1061 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  25.87 
 
 		 583 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  30.2 
 
 		 762 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.36 
 
 		 450 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  30.47 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  30.47 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  30.47 
 
 		 203 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  27.2 
 
 		 210 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  25.19 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1407  hypothetical protein  27.12 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00365871  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24893  predicted protein  26.95 
 
 		 428 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.43897  normal  0.425078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  25.31 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4058  ankyrin  30.43 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18840  ankyrin repeat-containing protein  28.29 
 
 		 467 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.065802 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3463  ankyrin  30.43 
 
 		 345 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03513  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 1262 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.93447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  26.92 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.14 
 
 		 382 aa  43.1  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  28.12 
 
 		 237 aa  42.7  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  33.77 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>