38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0828 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0828  bacteriophage lysis protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2899  bacteriophage lysis protein  91.72 
 
 		 145 aa  272  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000634964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0395  bacteriophage lysis protein  91.03 
 
 		 145 aa  272  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328386  hitchhiker  0.00000000000000531683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0305  bacteriophage lysis protein  93.79 
 
 		 145 aa  256  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1451  bacteriophage lysis protein  93.94 
 
 		 99 aa  190  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1184  bacteriophage lysis protein  60 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00247125  hitchhiker  0.0000000000330558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10031  cell lysis protein  58.55 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.025296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00729  hypothetical protein  58.55 
 
 		 153 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0229368  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00514  hypothetical protein  57.89 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00508  predicted murein endopeptidase  57.89 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1614  bacteriophage lysis protein  56.58 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2608  bacteriophage lysis protein  49.02 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.048327  normal  0.0317443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0893  bacteriophage lysis protein  53.21 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1273  bacteriophage lysis protein  47.4 
 
 		 157 aa  137  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3073  Phosphoprotein phosphatase  56.58 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1172  bacteriophage lysis protein  47.77 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.583234 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1138  bacteriophage lysis protein  46.75 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3207  bacteriophage lysis protein  50.64 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0122029 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1859  bacteriophage lysis protein  50.64 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000827785 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2783  bacteriophage lysis protein  48.41 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2251  bacteriophage lysis protein  48.05 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000357179 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3140  bacteriophage lysis protein  48.05 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000519306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0942  bacteriophage lysis protein  50 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1403  bacteriophage lysis protein  47.4 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000130995 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1532  bacteriophage lysis protein  48.08 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1777  bacteriophage lysis protein  47.74 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.0335187 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1066  bacteriophage lysis protein  47.97 
 
 		 159 aa  127  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3523  bacteriophage lysis protein  45.16 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.328283  hitchhiker  0.000434351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2247  bacteriophage lysis protein  46.15 
 
 		 155 aa  120  7e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.727629  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0632  bacteriophage lysis protein  46.15 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000814148  normal  0.106962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1152  bacteriophage lysis protein  41.26 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142023  hitchhiker  0.0000000000000115024 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2818  bacteriophage lysis protein  42 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.570005  normal  0.122766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01348  hypothetical protein  52.04 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.512118  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01338  predicted defective peptidase  52.04 
 
 		 99 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.604576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2181  bacteriophage lysis protein  39.33 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.225505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01976  hypothetical protein  41.76 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01347  hypothetical protein  93.33 
 
 		 36 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1744  lysis protein  27.81 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>