26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0673 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  98.72 
 
 
235 aa  484  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  98.72 
 
 
235 aa  484  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  96.6 
 
 
235 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  96.6 
 
 
235 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  95.74 
 
 
235 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  94.04 
 
 
235 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  59.57 
 
 
235 aa  291  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  59.15 
 
 
235 aa  289  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  59.15 
 
 
235 aa  289  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  59.15 
 
 
235 aa  289  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  58.72 
 
 
235 aa  285  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  58.3 
 
 
231 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  58.3 
 
 
231 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  58.3 
 
 
231 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  57.87 
 
 
231 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  60.29 
 
 
204 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  59.8 
 
 
204 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  59.8 
 
 
204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  59.8 
 
 
204 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4188  hypothetical protein  38.1 
 
 
234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4473  protein of unknown function DUF1266  36.8 
 
 
234 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.979526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1884  hypothetical protein  40.7 
 
 
231 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  91.89 
 
 
37 aa  72  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4553  hypothetical protein  34.88 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0896381  decreased coverage  0.00517061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2503  hypothetical protein  23.22 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.148433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>