25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01814 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01802  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01814  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1799  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  99.54 
 
 
218 aa  448  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2118  hydrolase, carbon-nitrogen family  99.54 
 
 
218 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2072  carbon-nitrogen family hydrolase  99.54 
 
 
218 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1934  carbon-nitrogen family hydrolase  98.62 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1789  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  98.62 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.103246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2578  hydrolase, carbon-nitrogen family  99.08 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484509  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1344  carbon-nitrogen family hydrolase  98.17 
 
 
218 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.217864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1372  carbon-nitrogen family hydrolase  66.06 
 
 
218 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000282362 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2091  carbon-nitrogen family hydrolase  66.06 
 
 
218 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2031  carbon-nitrogen family hydrolase  66.06 
 
 
218 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72758  normal  0.773103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1247  hydrolase, carbon-nitrogen family  66.06 
 
 
218 aa  308  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.557375  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2036  carbon-nitrogen family hydrolase  66.06 
 
 
218 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0891243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2414  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  50 
 
 
218 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0704  hypothetical protein  25.81 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.195549  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4898  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  21.86 
 
 
245 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.137387  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1050  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 
264 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2231  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  26.61 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.57041  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2821  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  41.25 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2803  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  34.34 
 
 
247 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0820852  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2660  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  35.35 
 
 
247 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543814  normal 
 
 
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NC_002947  PP_3019  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0944399  normal  0.171235 
 
 
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NC_013205  Aaci_2119  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N- acyltransferase  39.58 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_1378  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  25 
 
 
247 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0342857  normal 
 
 
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