17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2272 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  59.24 
 
 
237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  53.91 
 
 
260 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  49.58 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  46.85 
 
 
229 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  43.29 
 
 
235 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  38.12 
 
 
237 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  45.27 
 
 
186 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  43.62 
 
 
214 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  37.79 
 
 
211 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.4 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  32.6 
 
 
217 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  33.68 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  28.73 
 
 
391 aa  68.9  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  30.1 
 
 
334 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.15 
 
 
391 aa  52.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  25.64 
 
 
376 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>