15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1954 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1954  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0408  thiamineS protein  50 
 
 		 106 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2272  hypothetical protein  48.28 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0378  hypothetical protein  38.46 
 
 		 107 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2502  thiamineS protein  39.08 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00382478  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1701  thiamineS protein  38.2 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00127323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1649  hypothetical protein  37.21 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00308547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2429  hypothetical protein  51.72 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0150509  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0070  hypothetical protein  35.35 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0973  hypothetical protein  36.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3287  hypothetical protein  36.14 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2870  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0617124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2458  hypothetical protein  35.62 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  32.88 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  35.14 
 
 		 79 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>