24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1886 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1886  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
107 aa  213  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0158  HesB-like domain-containing protein  67.06 
 
 
106 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0195256 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2018  HesB-like domain-containing protein  65.17 
 
 
106 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000156848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1688  HesB/YadR/YfhF-family protein  66.27 
 
 
107 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.156984  normal  0.865777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2625  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.43 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0909  HesB/YadR/YfhF-family protein  58.43 
 
 
106 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.614145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0159  HesB-like domain-containing protein  44.33 
 
 
97 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0136748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1878  hypothetical protein  48.04 
 
 
101 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080584  hitchhiker  0.00286837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1484  HesB/YadR/YfhF-family protein  48.84 
 
 
103 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2865  HesB-like domain-containing protein  45.45 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053706  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1879  hypothetical protein  44.44 
 
 
104 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000257443  hitchhiker  0.00124508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1687  HesB-like domain-containing protein  41.86 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212563  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2020  HesB family selenoprotein  54.35 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000452157  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2019  hypothetical protein  71.88 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000993127  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0907  HesB/YadR/YfhF-family protein  61.29 
 
 
31 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.341762  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.77 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0666  HesB family selenoprotein  34 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000254552  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4034  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1950  HesB/YadR/YfhF-family protein  35.94 
 
 
95 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.550426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6870  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.48 
 
 
206 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1787  HesB/YadR/YfhF  39.62 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  34.33 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.69 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2652  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.25 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.758195  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>