17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1071 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1151  hypothetical protein  97.17 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2264  hypothetical protein  64.63 
 
 		 111 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  0.0845735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3611  hypothetical protein  52.69 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2284  hypothetical protein  45.63 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.176996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0121  hypothetical protein  27.27 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2407  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2357  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0731  hypothetical protein  30.99 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.871554  hitchhiker  0.000506327 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_130  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  26.44 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00019339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0248  hypothetical protein  24.72 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.512016  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1350  hypothetical protein  41.89 
 
 		 97 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2980  hypothetical protein  28.99 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00412022  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1288  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.727092  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1225  putative transmembrane protein  45.45 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37245  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2960  hypothetical protein  27.54 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.865336  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3015  hypothetical protein  27.54 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.116596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>