23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1528 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 67 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  82.09 
 
 		 68 aa  112  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  81.82 
 
 		 76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  81.25 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  68.66 
 
 		 75 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  68.75 
 
 		 73 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  64.06 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  62.69 
 
 		 72 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  61.19 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  61.19 
 
 		 74 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  50.82 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  46.77 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3896  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  34.38 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0066  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 262 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>