24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1000 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1000  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000480499 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3293  transcriptional regulator, XRE family  82.86 
 
 		 72 aa  120  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1655  hypothetical protein  70.59 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0636  transcriptional regulator, XRE family  59.7 
 
 		 75 aa  90.5  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1546  transcriptional regulator, XRE family  58.21 
 
 		 73 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00936975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1528  transcriptional regulator, XRE family  61.19 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000508526  hitchhiker  0.00000000279301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0370  hypothetical protein  59.38 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00225094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2865  transcriptional regulator, XRE family  56.92 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000773901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2426  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1465  transcriptional regulator  51.56 
 
 		 82 aa  72  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1108  hypothetical protein  52.24 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.594849  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3262  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.941421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1421  transcriptional regulator, XRE family  49.21 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0656  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0844  putative transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1464  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0705  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.45038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2154  putative transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440989  hitchhiker  0.00829248 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0330  hypothetical protein  43.75 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1909  putative transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000386637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3714  putative transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0303  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0351382  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2707  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4482  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111215  normal  0.686525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>