50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2299 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  786    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1538  hypothetical protein  42.64 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1833  hypothetical protein  41.74 
 
 		 371 aa  236  4e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1935  protein of unknown function DUF1611  39.81 
 
 		 354 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.614904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0205  protein of unknown function DUF1611  34.05 
 
 		 337 aa  176  9e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1378  protein of unknown function DUF1611  34.77 
 
 		 337 aa  152  7e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0130  hypothetical protein  33.44 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.550989  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0132  hypothetical protein  33.44 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1405  hypothetical protein  33.24 
 
 		 348 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0852  hypothetical protein  31.82 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.98076  normal  0.809264 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2372  hypothetical protein  33.9 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2779  hypothetical protein  34.29 
 
 		 348 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4403  protein of unknown function DUF1611  32.14 
 
 		 343 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.654147  hitchhiker  0.000982381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3511  hypothetical protein  33.74 
 
 		 348 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0593  protein of unknown function DUF1611  30.75 
 
 		 340 aa  144  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4341  protein of unknown function DUF1611  32.05 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2290  protein of unknown function DUF1611  31.36 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1206  protein of unknown function DUF1611  31.58 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.356367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1623  protein of unknown function DUF1611  33.69 
 
 		 363 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.631955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4542  hypothetical protein  34.11 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.398083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1770  hypothetical protein  31.97 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0416  hypothetical protein  31.97 
 
 		 333 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3166  hypothetical protein  29.59 
 
 		 333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4476  protein of unknown function DUF1611  32.74 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2482  hypothetical protein  31.79 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3589  protein of unknown function DUF1611  28.18 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0838311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0366  hypothetical protein  29.29 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3257  hypothetical protein  32.73 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.161607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4657  hypothetical protein  31.86 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2786  protein of unknown function DUF1611  34.44 
 
 		 329 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0792  hypothetical protein  27.17 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1220  protein of unknown function DUF1611  32.97 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06557  hypothetical protein  32.35 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3968  protein of unknown function DUF1611  30.69 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0847793  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0034  hypothetical protein  30.47 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0149  protein of unknown function DUF1611  31.29 
 
 		 335 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2676  hypothetical protein  30 
 
 		 336 aa  107  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal  0.475395 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2798  protein of unknown function DUF1611  31.15 
 
 		 336 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1462  hypothetical protein  31.95 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0204992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1127  hypothetical protein  31.95 
 
 		 340 aa  106  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2903  protein of unknown function DUF1611  29.63 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1819  hypothetical protein  32.96 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000678  EBNA-1 nuclear protein  29.41 
 
 		 334 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2557  hypothetical protein  32.25 
 
 		 335 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0502  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  23.17 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1406  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  22.68 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1230  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  23.05 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.102182  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1396  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  23.55 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.78245  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0165  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  26.29 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000255612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>