15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1907 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1907  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1012    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.27137  hitchhiker  0.000000104796 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1839  hypothetical protein  36.8 
 
 		 751 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011890  Mnod_7767  hypothetical protein  30.3 
 
 		 846 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6918  hypothetical protein  28.28 
 
 		 681 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2235  hypothetical protein  30.63 
 
 		 526 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.215413  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27548  predicted protein  31.3 
 
 		 689 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000091689  normal  0.509661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0602  hypothetical protein  34.62 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18136  predicted protein  31.3 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0028227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2898  hypothetical protein  25.93 
 
 		 825 aa  53.5  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.523858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  26.85 
 
 		 799 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2527  hypothetical protein  33.62 
 
 		 756 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  26.81 
 
 		 796 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0468  hypothetical protein  31.18 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1191  bifunctional DNA primase/polymerase  27.73 
 
 		 920 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0184938  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  30.12 
 
 		 778 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>