17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0422 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2497  peptidase  24.12 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2103  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.35 
 
 		 254 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.752082  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1967  peptidase propeptide/YPEB domain-containing protein  28.06 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0253954  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1922  peptidase  38.71 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3019  peptidase  29.01 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05920  Peptidase propeptide domain-containing protein  26.92 
 
 		 247 aa  44.7  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0420  hypothetical protein  27.34 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.183969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5667  peptidase  29.77 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.233343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.59 
 
 		 103 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4109  hypothetical protein  29.45 
 
 		 226 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0235678  normal  0.144991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22200  Peptidase propeptide domain-containing protein  32.14 
 
 		 253 aa  42  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0096  hypothetical protein  29.31 
 
 		 178 aa  41.6  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000129427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  39.68 
 
 		 114 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2191  hypothetical protein  26.62 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572744  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1470  Propeptide PepSY amd peptidase M4  28.03 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.482042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>