23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0167 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  100 
 
 		 127 aa  263  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  42.5 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  30.7 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  30.17 
 
 		 195 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  31.03 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  27.64 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  25.21 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  31.4 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  32.52 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  33.06 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  31.97 
 
 		 119 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  30 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  28.46 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  28.81 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  32.39 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  24.37 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  27.19 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  31.51 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  30.86 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  27.13 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  27.13 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  26.27 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>