30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2860 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2860  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
737 aa  1517    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1316  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.37 
 
 
742 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.157513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2168  peptidase  26.04 
 
 
731 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0287346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1339  Propeptide PepSY amd peptidase M4  25.17 
 
 
718 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000809561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0410  S-layer domain protein  23.94 
 
 
750 aa  146  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.208061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0563  S-layer domain-containing protein  23.32 
 
 
747 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2160  hypothetical protein  31.85 
 
 
146 aa  70.1  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2252  hypothetical protein  24.52 
 
 
831 aa  64.3  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.436101  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.46 
 
 
834 aa  61.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  28.95 
 
 
629 aa  60.8  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2561  hypothetical protein  21.71 
 
 
831 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  25.13 
 
 
548 aa  53.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  27.01 
 
 
1208 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  28.57 
 
 
660 aa  48.9  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  25.93 
 
 
578 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.37 
 
 
567 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1931  S-layer-like domain-containing protein  28.04 
 
 
521 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000922492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  26.67 
 
 
526 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25 
 
 
572 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  25.67 
 
 
585 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  29.56 
 
 
286 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.71 
 
 
567 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  26.11 
 
 
657 aa  45.4  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  26.11 
 
 
693 aa  45.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  21.83 
 
 
506 aa  44.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  24.42 
 
 
579 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1231 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.42 
 
 
348 aa  44.3  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  39.66 
 
 
396 aa  44.3  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.42 
 
 
397 aa  43.9  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>