21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1477 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  56.76 
 
 
94 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.46 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  42.67 
 
 
110 aa  61.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  38.67 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0363  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like  34.12 
 
 
90 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000167862  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1496  Protein of unknown function DUF2442  43.59 
 
 
78 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.367948  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  40.26 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  40.91 
 
 
88 aa  48.1  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1900  hypothetical protein  34.21 
 
 
101 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.030985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  38.81 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  37.33 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2540  hypothetical protein  30.59 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  29.11 
 
 
117 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2500  hypothetical protein  36 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00388461  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1819  hypothetical protein  33.75 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  32.31 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  32.1 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0654  hypothetical protein  29.11 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.169854  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  27.06 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>