26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0984 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0984  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
364 aa  749    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2458  glycosyltransferase-like protein  40.32 
 
 
378 aa  259  7e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2035  glycosyltransferase  41.51 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1759  glycosyltransferase-like protein  40.16 
 
 
378 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1403  glycosyl transferase group 1  37.99 
 
 
393 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.944674  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1530  glycosyl transferase, group 1  38.02 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1696  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 
366 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2856  glycosyltransferase-like protein  37.5 
 
 
376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2289  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2123  glycosyl transferase, group 1  37.54 
 
 
350 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.887263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0516  glycosyl transferase group 1  35.2 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.869562  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3631  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
363 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.190155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1606  glycosyl transferase, group 1  37.21 
 
 
357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.444102  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2466  glycosyl transferase group 1  30.35 
 
 
390 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2229  hypothetical protein  31.34 
 
 
353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2804  hypothetical protein  25.9 
 
 
327 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 
342 aa  47  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3299  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  27.01 
 
 
393 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4353  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.144729  normal  0.010377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0157  hypothetical protein  32.32 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  25.44 
 
 
358 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1370  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165091  normal  0.289041 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  40 
 
 
783 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.53 
 
 
391 aa  42.7  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>