12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0274 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0274  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 676 aa  1413    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0962  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 235 aa  109  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0807  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 242 aa  52  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0830  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 242 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1083  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 300 aa  50.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 256 aa  49.7  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 301 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  23.17 
 
 		 297 aa  47.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 298 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 		 258 aa  47.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 281 aa  44.7  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>