18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2851 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2851  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
100 aa  199  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.48842e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1895  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.17 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00163146  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2047  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.95 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2518  carboxymuconolactone decarboxylase  26.6 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.541729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2324  carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.26 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2557  hypothetical protein  34.48 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.059433  normal  0.792105 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  34.67 
 
 
98 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.74 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.58 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1262  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.579197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0078  carboxymuconolactone decarboxylase  27.38 
 
 
135 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>