17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_R0034 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_R0034  tRNA-Gln  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.144366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0039  tRNA-Gln  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0010  tRNA-Gln  95.83 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.505008  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0028  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0390985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0012  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0012  tRNA-Gln  97.06 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0990174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0040  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0202702  normal  0.855024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0043  tRNA-Gln  89.13 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0047  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08660  tRNA-Gln  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0040  tRNA-Gln  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000000983405  normal  0.398692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18610  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0924107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0053  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0018  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0045  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>