18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5108 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  903    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  26.79 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  24.89 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  24.78 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  23.88 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  22.82 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  24.12 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  22.05 
 
 		 462 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  22.27 
 
 		 444 aa  95.1  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  22.88 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  23.47 
 
 		 440 aa  91.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  21.98 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  21.41 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  22.55 
 
 		 483 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  20.5 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  22.42 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  40.68 
 
 		 403 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  20.58 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>