298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4987 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2997  Polyphosphate kinase  61.94 
 
 
788 aa  1005    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4987  polyphosphate kinase  100 
 
 
780 aa  1605    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.894338  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1414  polyphosphate kinase  59.43 
 
 
709 aa  816    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.350457  normal  0.011131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1262  polyphosphate kinase  40.03 
 
 
760 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.53727  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1153  polyphosphate kinase  38.48 
 
 
769 aa  506  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.862565  unclonable  0.0000000856651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3540  polyphosphate kinase  40.66 
 
 
708 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.209178  normal  0.145043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2107  polyphosphate kinase  41.83 
 
 
715 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0112201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2316  Polyphosphate kinase  39.09 
 
 
710 aa  499  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0973  Polyphosphate kinase  37.19 
 
 
882 aa  495  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0281378  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1105  Polyphosphate kinase  40.23 
 
 
681 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.608169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2695  polyphosphate kinase  40.09 
 
 
702 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0725935  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3719  Polyphosphate kinase  40.21 
 
 
823 aa  485  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2844  Polyphosphate kinase  38.15 
 
 
728 aa  479  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1431  polyphosphate kinase  39.44 
 
 
715 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1016  polyphosphate kinase  39.3 
 
 
707 aa  476  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.054944 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1333  polyphosphate kinase  38.37 
 
 
709 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4098  polyphosphate kinase  39.12 
 
 
702 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4578  polyphosphate kinase  37.64 
 
 
731 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.763447  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3822  polyphosphate kinase  38.86 
 
 
702 aa  475  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0259  Polyphosphate kinase  39.01 
 
 
705 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4050  Polyphosphate kinase  37.84 
 
 
691 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0218639  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1576  Polyphosphate kinase  38.52 
 
 
701 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4043  polyphosphate kinase  39.05 
 
 
700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0464  polyphosphate kinase  40.63 
 
 
712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.698242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3903  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3735  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3751  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4010  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3165  polyphosphate kinase  37.82 
 
 
736 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615154  normal  0.0295418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4208  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1321  polyphosphate kinase  40.98 
 
 
709 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4115  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.439762  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03530  polyphosphate kinase  35.96 
 
 
770 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.270517  normal  0.858348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1482  polyphosphate kinase  38.01 
 
 
763 aa  468  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622113  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0877  polyphosphate kinase  36.3 
 
 
721 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.252676  hitchhiker  0.00257913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0431  polyphosphate kinase  39.16 
 
 
696 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3428  polyphosphate kinase  37.41 
 
 
731 aa  469  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890259  normal  0.75976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8258  Polyphosphate kinase  38.28 
 
 
697 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2402  Polyphosphate kinase  37.39 
 
 
720 aa  467  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.288166  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0323  polyphosphate kinase  38.91 
 
 
702 aa  465  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3717  polyphosphate kinase  39.42 
 
 
708 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262385  normal  0.013804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3000  Polyphosphate kinase  37.63 
 
 
693 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6002  polyphosphate kinase  37.35 
 
 
712 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3618  polyphosphate kinase  37.41 
 
 
750 aa  465  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.855014 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1041  polyphosphate kinase  38.57 
 
 
713 aa  463  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000177929  hitchhiker  0.0000312849 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3092  polyphosphate kinase  40.2 
 
 
727 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17222  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2681  polyphosphate kinase  37.72 
 
 
695 aa  462  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1625  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
722 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1259  polyphosphate kinase  37.74 
 
 
713 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00202694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1652  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
722 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169511  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0573  polyphosphate kinase  36.4 
 
 
743 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09100  polyphosphate kinase  37.39 
 
 
743 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378192  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2726  polyphosphate kinase  37.37 
 
 
749 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00899985 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1358  polyphosphate kinase  39.29 
 
 
708 aa  458  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33500  polyphosphate kinase  36.44 
 
 
765 aa  459  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.418416  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2815  Polyphosphate kinase  36.39 
 
 
744 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.630295  normal  0.0696089 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1566  polyphosphate kinase  37.36 
 
 
731 aa  456  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0569549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1035  polyphosphate kinase  39.14 
 
 
713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988005  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3211  Polyphosphate kinase  37.39 
 
 
737 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1114  polyphosphate kinase  37.38 
 
 
720 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4257  polyphosphate kinase  37.16 
 
 
696 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0705016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0900  polyphosphate kinase  38.12 
 
 
707 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0616  polyphosphate kinase  37.97 
 
 
721 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3014  polyphosphate kinase  36.79 
 
 
749 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8611  Polyphosphate kinase  37.74 
 
 
687 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0243  polyphosphate kinase  36.15 
 
 
710 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.614711  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5220  Polyphosphate kinase  36.01 
 
 
703 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3471  Polyphosphate kinase  38.16 
 
 
700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.448785  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1280  polyphosphate kinase  36.56 
 
 
721 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1959  polyphosphate kinase  36.36 
 
 
743 aa  445  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0981699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5985  polyphosphate kinase  37.76 
 
 
736 aa  443  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1593  polyphosphate kinase  36.78 
 
 
745 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0889  polyphosphate kinase  37.21 
 
 
720 aa  445  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.106725  normal  0.22922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4223  polyphosphate kinase  35.88 
 
 
729 aa  445  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0302  Polyphosphate kinase  36.25 
 
 
762 aa  445  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0438  polyphosphate kinase  37.67 
 
 
726 aa  445  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.251361 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1011  Polyphosphate kinase  38.44 
 
 
729 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18301  polyphosphate kinase  36.42 
 
 
705 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69230  polyphosphate kinase  37.76 
 
 
736 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120592  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18871  polyphosphate kinase  37.25 
 
 
694 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1580  polyphosphate kinase  36.22 
 
 
753 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.126677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1116  polyphosphate kinase  35.72 
 
 
738 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3999  polyphosphate kinase  37.82 
 
 
739 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249007  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1789  polyphosphate kinase  37.81 
 
 
692 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1603  Polyphosphate kinase  35.23 
 
 
705 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1678  polyphosphate kinase  38.11 
 
 
775 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000637841  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1629  polyphosphate kinase  36.21 
 
 
704 aa  439  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.269365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5040  polyphosphate kinase  37.04 
 
 
746 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.366071  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18871  polyphosphate kinase  37.24 
 
 
692 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2047  polyphosphate kinase  36.61 
 
 
721 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1905  polyphosphate kinase  36.51 
 
 
742 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5250  polyphosphate kinase  37.76 
 
 
736 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47440  polyphosphate kinase  35.83 
 
 
740 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.440111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0938  polyphosphate kinase  36.04 
 
 
695 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12999  polyphosphate kinase  36.77 
 
 
741 aa  435  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0382  polyphosphate kinase  36.72 
 
 
691 aa  435  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1795  polyphosphate kinase  36.56 
 
 
828 aa  435  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0761388 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19061  polyphosphate kinase  37.23 
 
 
692 aa  436  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.547171  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39859  predicted protein  37.77 
 
 
813 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00638438  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1971  polyphosphate kinase  36.51 
 
 
742 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>