19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2135 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2135  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  1048    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2786  hypothetical protein  58.44 
 
 
473 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1804  hypothetical protein  53.97 
 
 
467 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611793  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4089  hypothetical protein  48.67 
 
 
468 aa  492  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6336  hypothetical protein  39.16 
 
 
462 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1335  hypothetical protein  38.43 
 
 
455 aa  293  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0402  hypothetical protein  37.07 
 
 
442 aa  283  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3064  hypothetical protein  38.2 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1804  hypothetical protein  36.68 
 
 
447 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2186  hypothetical protein  36.89 
 
 
444 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.0421946 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2666  hypothetical protein  36.6 
 
 
441 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0206  hypothetical protein  33.33 
 
 
483 aa  239  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.744086  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3386  hypothetical protein  26.57 
 
 
440 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1907  hypothetical protein  25.54 
 
 
420 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1057  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0341619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5108  hypothetical protein  21.98 
 
 
436 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.15198 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0434  hypothetical protein  24.2 
 
 
444 aa  86.3  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01791  conserved hypothetical protein  30.38 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.927526  normal  0.421741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1688  hypothetical protein  22.35 
 
 
407 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.643287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>