More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1956 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1956  adenylate kinase  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2028  adenylate kinase  86.1 
 
 		 229 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1235  adenylate kinase  82.51 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0293  adenylate kinase  83.41 
 
 		 223 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.229067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1683  adenylate kinase  79.37 
 
 		 224 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.196522  normal  0.133038 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0784  adenylate kinase  74.32 
 
 		 222 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0235014  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0469  adenylate kinase  68.3 
 
 		 224 aa  311  6.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  39.37 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  38.57 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  42.6 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  40 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  41.15 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  43.96 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  38.57 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  46.24 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.86 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.4 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  39.91 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  43.72 
 
 		 213 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  36.61 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.77 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  39.91 
 
 		 217 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  38.84 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.77 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.41 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  40.37 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  38.57 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  42.31 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  40.18 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  40.28 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  43.93 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  39.81 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  40.93 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  37.5 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  41.21 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  41.62 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  37.22 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  37.95 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  36.77 
 
 		 217 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  42.2 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  42.2 
 
 		 215 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0472  adenylate kinase  36.04 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00114674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  37.22 
 
 		 214 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  36.7 
 
 		 367 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  40.98 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  40.98 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  37.18 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0495  adenylate kinase  36.04 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  34.53 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_437  adenylate kinase  36.04 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000304823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  40.54 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  36.9 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  36.82 
 
 		 214 aa  131  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  36.56 
 
 		 214 aa  132  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  42.77 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  40.33 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  46.67 
 
 		 189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  34.08 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  36.32 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  36.53 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.43 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  37.44 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  39.89 
 
 		 208 aa  128  7.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  34.82 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  35.29 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  35.87 
 
 		 214 aa  127  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  37.16 
 
 		 374 aa  128  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  34.08 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  35.43 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  34.8 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  38.25 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  35.43 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  40.66 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  38.14 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0419  adenylate kinase  41.42 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0670821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  34.82 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  36.81 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  35.68 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  37.44 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  34.53 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  35.68 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>