28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1314 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1314  virulence factor SrfC-like protein  100 
 
 		 878 aa  1809    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1963  virulence factor SrfC-like protein  36.67 
 
 		 862 aa  479  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3153  virulence factor protein  35.4 
 
 		 901 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.490604  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0898  hypothetical protein  34.51 
 
 		 892 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4053  hypothetical protein  32.71 
 
 		 890 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0957492  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2631  hypothetical protein  33.41 
 
 		 899 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.631713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2872  HopL1 protein  32.41 
 
 		 899 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52070  hypothetical protein  32.41 
 
 		 910 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1844  hypothetical protein  31.2 
 
 		 893 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0469  Virulence effector, SrfC  29.83 
 
 		 888 aa  330  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4238  hypothetical protein  29.13 
 
 		 881 aa  327  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3217  virulence factor SrfC-like protein  30.57 
 
 		 835 aa  322  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.933423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6480  hypothetical protein  27.75 
 
 		 938 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2095  putative virulence factor  30.94 
 
 		 820 aa  185  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.180077  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2100  putative virulence factor  29.58 
 
 		 844 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1880  putative virulence factor  29.45 
 
 		 832 aa  180  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.332226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2383  Virulence effector, SrfC  29.58 
 
 		 815 aa  171  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.971346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1842  hypothetical protein  29.38 
 
 		 846 aa  153  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2110  putative virulence protein  23.68 
 
 		 726 aa  99.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.867276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1952  putative virulence factor  27.76 
 
 		 679 aa  92  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2284  hypothetical protein  27.76 
 
 		 674 aa  90.5  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.869648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1710  putative virulence effector protein  22.34 
 
 		 714 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1775  putative virulence effector protein  22.08 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.837936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1746  putative virulence effector protein  21.12 
 
 		 714 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1713  putative virulence effector protein  22.19 
 
 		 714 aa  85.5  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1565  putative virulence effector protein  22.65 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2282  virulence factor  37.12 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1433  putative virulence factor  21.84 
 
 		 743 aa  66.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>