17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0145 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0145  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2682  hypothetical protein  50 
 
 
260 aa  214  7e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2272  hypothetical protein  49.58 
 
 
251 aa  184  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0372  hypothetical protein  43.4 
 
 
237 aa  174  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2517  hypothetical protein  38.36 
 
 
235 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.40178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3216  hypothetical protein  37 
 
 
229 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0137  hypothetical protein  42.38 
 
 
237 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.357956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2086  hypothetical protein  39.67 
 
 
186 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3322  hypothetical protein  34.88 
 
 
211 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1562  heat domain-containing protein  31.11 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.882517  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1745  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.72 
 
 
221 aa  87.4  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00565425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2929  heat domain-containing protein  27.03 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0645262  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2196  heat domain-containing protein  30.34 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1333  methylated-DNA/protein-cysteine methyltransferase  26.32 
 
 
391 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1597  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 
391 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000656599  normal  0.759481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2089  hypothetical protein  30.05 
 
 
334 aa  55.1  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0085  hypothetical protein  24.02 
 
 
376 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.42821  hitchhiker  0.00374678 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>