31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3272 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3272  propanediol utilization protein (PduT)-like  100 
 
 		 182 aa  354  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1366  microcompartments protein  56.74 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2231  polyhedral body protein  38.33 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.265941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2277  polyhedral body protein  37.78 
 
 		 184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0109336 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2390  polyhedral body protein  38.33 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2224  polyhedral body protein  37.78 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0143783  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2177  polyhedral body protein  37.78 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0360  microcompartments protein  36.46 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2056  microcompartments protein  35.96 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1916  microcompartments protein  36.46 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0085  microcompartments protein  35.03 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2295  propanediol utilization protein PduT  37.78 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1303  microcompartments protein  36.05 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3265  putative propanediol utilization protein PduT  38.95 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4895  microcompartments protein  35.5 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1371  microcompartments protein  36.11 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0901  ethanolamine utilization protein  34.01 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1186  microcompartments protein  33.33 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2636  microcompartments protein  31.46 
 
 		 185 aa  87.8  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3269  microcompartments protein  38.13 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.942262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1244  microcompartments protein  34.29 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5812  microcompartments protein  30.86 
 
 		 205 aa  67.8  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.723553  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1939  microcompartments protein  28.49 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1683  carboxysome shell peptide  31.31 
 
 		 112 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.373595  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1381  microcompartments protein  31.31 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1359  microcompartments protein  35.23 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1355  microcompartments protein  27.27 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.431976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4467  microcompartments protein  35.34 
 
 		 260 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3280  carbon dioxide concentrating mechanism/carboxysome shell protein-like  34.83 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0915  microcompartments protein  30.34 
 
 		 98 aa  41.2  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1421  putative carboxysome assembly protein  40 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00194265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>