21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3115 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3115  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  100 
 
 		 105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000341889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0351  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  56.31 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0657  carboxymuconolactone decarboxylase domain-containing protein  50 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0462  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.37 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1558  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.43 
 
 		 109 aa  90.5  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.320867  normal  0.635066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1693  carboxymuconolactone decarboxylase  35.64 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0196  carboxymuconolactone decarboxylase  31.96 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.666499  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.35 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.47 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2511  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.23 
 
 		 281 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2472  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.05 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  28.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  28.89 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0717  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.226817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4478  4-carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  33.82 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4169  carboxymuconolactone decarboxylase  28.93 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.944589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3760  carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  33.87 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0518  hypothetical protein  32.26 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>