42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3831 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3831  phage major capsid protein, P2 family  100 
 
 
351 aa  725    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2643  phage major capsid protein, P2 family  52.16 
 
 
349 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.22943  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1397  phage major capsid protein, P2  46.22 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4325  phage major capsid protein GpN  42.98 
 
 
357 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0111695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3050  phage major capsid protein GpN  42.69 
 
 
357 aa  289  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01361  phage major capsid protein, P2 family  42.94 
 
 
338 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0582174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2914  P2 family phage major capsid protein  43.6 
 
 
334 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0205  P2 family phage major capsid protein  42.61 
 
 
339 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1937  bacteriophage protein  42.98 
 
 
338 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3173  phage major capsid protein, P2 family  40.91 
 
 
375 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1350  P2 family phage major capsid protein  41.5 
 
 
337 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4837  P2 family phage major capsid protein  40.82 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892596  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3499  P2 family phage major capsid protein  40.91 
 
 
364 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0440112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2329  P2 family phage major capsid protein  40.8 
 
 
351 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3291  P2 family phage major capsid protein  40.99 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37590  Phage P2 major capsid precursor gpN-like protein  41.06 
 
 
335 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2866  phage major capsid protein, P2 family  41.62 
 
 
353 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3048  phage major capsid protein, P2 family  40.75 
 
 
352 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000831709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0926  P2 family phage major capsid protein  41.04 
 
 
352 aa  262  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2775  P2 family phage major capsid protein  41.04 
 
 
352 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.765557  decreased coverage  0.0000193345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4366  phage major capsid protein P2 family  40.52 
 
 
386 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000142704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0702  P2 family phage major capsid protein  37.38 
 
 
340 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5054  P2 family phage major capsid protein  37.38 
 
 
340 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0357  P2 family phage major capsid protein  34.6 
 
 
342 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0697  P2 family phage major capsid protein  33.43 
 
 
344 aa  179  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.788074  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0771  phage major capsid protein  34.29 
 
 
344 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0585  P2 family phage major capsid protein  31.49 
 
 
344 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0745  major capsid protein  31.17 
 
 
338 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2765  P2 family phage major capsid protein  29.6 
 
 
341 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.758971 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1470  P2 family phage major capsid protein  29.6 
 
 
341 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.321687  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0241  phage major capsid protein, P2 family  28.57 
 
 
344 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05027  hypothetical protein  27.33 
 
 
336 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1284  P2 family phage major capsid protein  26.79 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0722  P2 family phage major capsid protein  28.27 
 
 
340 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1055  P2 family phage major capsid protein  26.35 
 
 
340 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0899  P2 family phage major capsid protein  28.15 
 
 
343 aa  99.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.425195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1028  major capsid protein  27.3 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2798  phage major capsid protein, P2 family  27.76 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3491  phage major capsid protein, P2 family  25.99 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35706e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2934  phage major capsid protein P2 family  25.99 
 
 
340 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  7.04671e-22 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0941  P2 family phage major capsid protein  24.23 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2646  major capsid protein  25.57 
 
 
334 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>